Низкорослый кустарник, часто стелющийся или распростертый по поверхности почвы. Имеет короткий прирост, мелкие (4-8 мм) листья, искривленные и несколько прижатые к ветвям. В целом он близок по многим признакам к предыдущему виду, но несет отпечаток суровых горных и арктических условий, в которых он обитает. Некоторые авторы считают его экологической горной вариацией Juniperus communis (var. montana Ait. или var. sibirica Burgsd.). В культуру он не введен, но в перспективе может использоваться для посадки в северных городах, а также и южнее для садов и парков в качестве декоративной низкорослой или стелющейся формы. Его ареал располагается в равнинных и горных тундрах, лесотундре и отчасти в лесной зоне Северного и Приполярного Урала и по высокогорьям идет до Южного Урала, где образует заросли вблизи верхней границы леса. Распространен он также в Скандинавии, на Крайнем Севере европейской части СССР, Сибири, Дальнего Востока. В горах Средней Европы, Средней Азии, Японии растет очень близкая форма - можжевельник низкий (Juniperus nana Willd.).
Можжевельник сибирский связан переходными формами с обыкновенным. Не исключено, что во многих случаях за Juniperus sibirica принимают угнетенные экземпляры J. communis. В общем видовая обособленность рассматриваемой формы пока не ясна.
Можжевельник сибирский неприхотлив к почве, может расти и на скалистом субстрате с малым количеством мелкозема, и на торфянистой почве. Исключительно вынослив по отношению к климатическим условиям.